Ammattilaiselle Murupolku Etusivu Ammattilaiselle Ammattilaisten palvelut ja ohjeet Genomiikka – ammattilaiselle Toistojaksotaudit Toistojaksotaudit Avainsanat: Genomiikka Toistojaksotaudeilla tarkoitetaan sairauksia, joiden syntymekanismina on perimässä olevan DNA:n yksittäisen toistojakson laajentuma, joka laajetessaan geenikohtaisen kynnysarvon yli, sammuttaa geenin toiminnan tai häiritsee normaalin proteiinin muodostumista. Toistojaksotauteihin kuuluu erityisesti erilaisia neurologisia neurodegeneratiivisia ja neuromuskulaarisia sairauksia, joiden oireet johtuvat hermoston rappeutumisesta. Merkittävä osa toistojaksotaudeista on luonteeltaan eteneviä. Suuressa osassa toistojaksotaudeista toistojaksolaajentuma voi laajentua sukupolvelta toiselle, jolloin seuraavassa sukupolvessa oireet voivat alkaa aiemmin ja oireet voivat olla vakavampia. Toistojaksoalueen laajentumisen riski seuraavassa sukupolvessa voi riippua siitä, kummalta vanhemmalta toistojakso periytyy lapselle. Esimerkiksi Huntingtonin taudissa toistojakso laajenee erityisesti periytyessään isältä lapselle.Toistojaksotaudit voivat periytyä autosomaalisesti vallitsevasti, autosomaalisesti peittyvästi tai X-kromosomaalisesti.Toistojaksotaudit voivat periytyä autosomaalisesti vallitsevasti, autosomaalisesti peittyvästi tai X-kromosomaalisesti.Milloin erityisesti tulee epäillä toistojaksotauteja?Fragiili-X-oireyhtymä on yleisin kehitysvammaisuutta aiheuttava perinnöllinen sairaus, joka suositellaan tutkittavaksikehitysvammaisuuden etiologisena selvittelynä sekä pojilla että tytöillä, mikäli eksomisekvensoinnissa ei löydy selittävää.Spinoserebellaariset ataksiat, CANVAS (Cerebellar Ataxia with Neuropathy and Vestibular Areflexia Syndrome) ja Fragiili-X oireyhtymään liittyvä vapina-ataksiaoireyhtymä (Fragile X-Associated Tremor/Ataxia Syndrome FXTAS)-oireyhtymät tulee muistaa merkittävänä osana ataksia-sairauksia.CANVAS-sairauteen voi viitata sensorinen neuropatia, pikkuaivoataksia, tasapainoelimen toimintahäiriö ja krooninen yskä .Perinnöllinen ALS ja frontotemporaalidementia johtuvat tavallisimmin C9orf72-geenin toistojaksolaajentumasta.Dystrofia myotonica tyyppi 1 ja 2 ovat tavallisia aikuisilla esiintyviä lihasdystrofiaa aiheuttavia sairauksia, jotka johtuvat toistojaksolaajentumasta. Dystrofia myotonica 1 voi laajentuessaan sukupolvelta toiselle aiheuttaa vaikean synnynnäisen muodon.Suomalaiseen tautiperimään kuuluva progressiivinen myoklonusepilepsia tyyppi 1 (EPM1) eli Unverricht-Lundborgin tauti aiheuttaa lapsuusiällä alkavan neurologisen sairauden, johon liittyy epileptisiä kohtauksia ja lihasnykäyksiä. EPM1 johtuu CSTB-geenin toistojaksolaajentumasta. Tutkimusta ei ole tarjolla Tyks Genomiikan tutkimusvalikoimassa, joten tutkimus tulee tilata ErisopGen-alihankintatutkimuksena.Linkit:Ohjeita lähetteiden tekemiseenTutkimusohjekirjaPerinnölliset geenipaneelitutkimuksetGenomiikan laboratorion kautta tilattavat alihankintatutkimukset Varha-yksiköilleTyks laboratorioiden lähetteet ja läheteohjeet Toistojaksotautien syntymekanismista ja DNA-tutkimukset Ihmisen perimäaines koostuu DNA:sta, joka sisältää geenien muodossa kaikkien kehomme erilaisten proteiinien rakennusohjeet. Vaikka geenit kattavat vain pienen osan koko DNA:sta, on niiden merkitys sairauksien synnyssä suuri.Toistojaksolaajentuma voi sijaita geenin koodaavalla alueella eksonissa, eksonien välissä olevassa intronissa tai geenin aktiivisuutta säätelevällä promoottorialueella. Toistojaksolaajentuman sijainti geenissä vaihtelee eri toistojaksotaudeissa.Toistojaksotauteja ei voida yleensä tutkia perinteisellä NGS-menetelmällä (Next-generation Sequencing), joten esimerkiksi geenipaneelitutkimuksilla ei voida osoittaa toistojaksolaajentumia luotettavasti.Toistojaksotauteja tutkitaan käyttämällä PCR (polymerase chain reaction) menetelmää ja fragmenttianalyysiä tai RP-PCR (repeat primed polymerase chain reaction) menetelmää ja fragmenttianalyysiä. Fragiili X-oireyhtymä sekä FMR1-geeniin liittyvä FXTAS-sairaus ja munasarjojen ennenaikainen vajaatoiminta (primary ovarian insufficiency, POI) B-FraX-D B -Fragiili-X,-FMR1-geenin DNA-tutkimus (4112)Ts-FraX-D Ts-Fragiili-X, FMR1-geenin DNA-tutkimus (4306)Fragiili-X-kehitysvammaoireyhtymä johtuu FMR1-geenin toistojaksolaajentumasta, joka laajentuessaan yli 200 toistojakson laajuiseksi täysmutaatioksi, sammuttaa geenin toiminnan. FMR1-geenin esimutaatio (55-200 toistojaksoa) aiheuttaa toisaalta geenin liiallisen aktivaation, jolloin esimutaation kantajilla on riski FMR1-geeniin liittyvään FXTAS-sairauteen ja munasarjojen ennenaikaiseen vajaatoimintaan. Huntingtonin tauti B-HUNT-D B -Huntingtonin tauti, ITI5-geenin toistojakson ekspansion DNA-tutkimus (4656)Ts-HUNT-D Huntingtonin tauti, IT-15-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus kudosnäytteestä (12211)Erotusdiagnostisena vaihtoehtona voi harkita DRPLA-sairauden (Dentatorubral-pallidoluysian atrophy) tutkimusta, mutta kyseinen sairaus on hyvin harvinainen suomalaisessa väestössä. Tutkimusta ei ole tarjolla Tyks Genomiikan tutkimusvalikoimassa, joten tutkimus tulee tilata Erisopgen-alihankintatutkimuksena. Kennedyn tauti eli spinobulbaarinen lihasatrofiatauti (SBMA) B-SBMA-D Kennedyn syndrooma, AR-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12009) CANVAS-tauti B-CANVAS CANVAS, RFC1-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verinäytteestä (14910) ALS ja frontotemporaalidementia B-C9ORF-D Amyotrofinen lateraaliskleroosi (ALS) ja frontotemporaalidementia (FTD) C9ORF72-toistojaksomutaation osoitus verestä (13532)Ts-C9ORF-D Amyotrofinen lateraaliskleroosi (ALS) ja frontotemporaalidementia (FTD) C9ORF72-toistojaksomutaation osoitus kudoksesta (13533) Perinnölliset ataksiat Spinoserebellaarisista ataksioista yleisimpiä ovat Suomessa SCA1, SCA7 ja SCA8, mutta eri väestöissä on eroavaisuuksiaB-CANVAS CANVAS, RFC1-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verinäytteestä (14910)B-FRDA-D Friedreichin ataksia, frataksiinigeenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12003)B-SCA1-D B -Spinocerebellar ataxia, tyyppi 1, DNA-tutkimus (4357)B-SCA2-D Spinocerebellaariataksia 2, ataksiini 2-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12239)B-SCA3-D Spinocerebellaariataksia 3, ataksiini 3-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12241)B-SCA6-D Spinocerebellaariataksia 6, CACNL1A4-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12243)B-SCA7-D Spinocerebellaariataksia 7, ataksiini 7-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutukimus verestä (12245)B-SCA8-D Spinocerebellaariataksia 8, ataksiini 8-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12247)B-SCA17-D Spinocerebellaariataksia 17, TBT-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12253)B-FGF14 SCA27B, FGF14-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verinäytteestä (14913)Erotusdiagnostisena vaihtoehtona voi harkita DRPLA-sairauden (Dentatorubral-pallidoluysian atrophy) tutkimusta, mutta kyseinen sairaus on hyvin harvinainen suomalaisessa väestössä. Tutkimusta ei ole tarjolla Tyks Genomiikan tutkimusvalikoimassa, joten tutkimus tulee tilata Erisopgen-alihankintatutkimuksena. Dystrofia myotonica tyyppi 1 ja 2 B-DM-D B -Myotoninen dystrofia tyyppi 1 (DM1), DMPK-geenin toistojakson ekspansion DNA-tutkimus (4648)Ts-DM-D Ts-Myotoninen dystrofia tyyppi 1 (DM1), DMPK-geenin toistojakson ekspansion DNA-tutkimus (4649)B-DM2ALLD B -Dystrofia myotonica tyyppi 2 (DM2), ZNF9-geenin toistojakson alleelikokojen DNA-tutkimus (4889) Okulofaryngeaalinen lihasdystrofia B-OPMD-D Okulofaryngeaalinen lihasdystrofia, PABP2-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus verestä (12011) Tulosta sivu